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Su pasado es desconocido, lo único que se conoce sobre él, es que nació el mismo día del Segundo Impacto. Cuando la humanidad estaba al borde de la extinción.

Kaworu, un piloto enviado a NERV por parte de SEELE como piloto de reemplazo para la Unidad-02. En su presentacion frente a Shinji, logra deducir facilmente la situación emocional por la que está pasando y empática con él. Esto llama la atención de Shinji, y ambos logran socializar fácilmente; durante las pruebas de sincronización, Kaworu demuestra un increible nivel de sincronización con la Unidad-02, despertando las sospechas de Misato sobre él. Solo para descubrir, que es un ángel con un cuerpo humano.

Siguiendo las órdenes por parte de SEELE, Kaworu utiliza la Unidad-02 para localizar el cuerpo físico de Adán, el primer ángel y el causante del Segundo Impacto. Misato en respuesta, envía a Shinji junto a la Unidad-01 para detenerlo, pero Kaworu descubre que es Lilith el segundo ángel el que se encuentra en NERV. Al lograr comprender el plan de SEELE, le pide a Shinji que lo mate Shinji se niega pero sabe que si no lo hace, la humanidad entera morirá. "la muerte, es la única libertad absoluta" le dice Kaworu a Shinji previo a su muerte.